Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm12163-201ENSMUST00000121597 389 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm12932-201ENSMUST00000143705 620 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm26184-201ENSMUST00000157686 131 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm5539-201ENSMUST00000192177 966 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Serpinb6d-202ENSMUST00000221681 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC165254.1-203ENSMUST00000222925 574 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Pudp-201ENSMUST00000056460 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm16391-201ENSMUST00000086601 447 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Extl2-202ENSMUST00000106501 2887 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr467-203ENSMUST00000214253 1855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Nxpe4-202ENSMUST00000215780 2875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm4863-201ENSMUST00000196907 1381 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm12838-201ENSMUST00000116278 325 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm26351-201ENSMUST00000157532 232 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm8065-201ENSMUST00000164048 605 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm5327-201ENSMUST00000182864 1009 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms