Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Cyp19a1-203ENSMUST00000215736 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Olfr664-202ENSMUST00000211596 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm14830-201ENSMUST00000121899 700 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Fgf2-202ENSMUST00000091203 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Stx8-202ENSMUST00000021286 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
H2-Eb1P04230 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.4 ms