Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm9670-201ENSMUST00000121201 540 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm28126-201ENSMUST00000185286 356 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm18970-201ENSMUST00000186040 938 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm28212-201ENSMUST00000187114 356 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm29568-201ENSMUST00000187884 356 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm29080-201ENSMUST00000188565 356 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm28944-201ENSMUST00000188946 356 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm28908-201ENSMUST00000189002 356 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm29078-201ENSMUST00000190611 356 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Fgf2-202ENSMUST00000091203 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm15062-201ENSMUST00000120567 367 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Cldn34c3J3QJW5 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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