Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Uqcrq-202ENSMUST00000109019 504 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rrn3B2RS91 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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