Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Fxyd5-201ENSMUST00000009831 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Bcl2a1d-201ENSMUST00000098486 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Hist1h4f-201ENSMUST00000102971 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Hist1h4h-201ENSMUST00000102972 470 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm11953-201ENSMUST00000122352 1003 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm13536-201ENSMUST00000132913 766 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Rnf141-210ENSMUST00000177462 859 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm20765-201ENSMUST00000177792 795 ntAPPRIS P2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm21312-201ENSMUST00000179258 795 ntAPPRIS P2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm18353-201ENSMUST00000185906 784 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm29453-201ENSMUST00000186428 1279 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AC108846.3-201ENSMUST00000214078 247 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm4178-201ENSMUST00000218307 649 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rnf4Q9QZS2 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 4933408N05Rik-201ENSMUST00000139864 1584 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rnf4Q9QZS2 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Glcci1-202ENSMUST00000161217 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rnf4Q9QZS2 Tpbpa-201ENSMUST00000021885 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rnf4Q9QZS2 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Rnf4Q9QZS2 Fam166b-202ENSMUST00000107928 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm2214-201ENSMUST00000121333 330 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm14143-201ENSMUST00000121686 357 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm26070-201ENSMUST00000157500 137 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 5830468F06Rik-201ENSMUST00000184288 1104 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm28401-202ENSMUST00000190769 550 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm37450-201ENSMUST00000195218 170 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Mir7230-201ENSMUST00000195977 56 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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