Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 1700041I07Rik-201ENSMUST00000197536 435 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Cyb5r2-202ENSMUST00000208217 1178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm5654-201ENSMUST00000217787 475 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 AC131745.3-201ENSMUST00000223582 554 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 AC140462.1-201ENSMUST00000225776 853 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 AC140406.2-201ENSMUST00000227539 481 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Psors1c2-201ENSMUST00000025273 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Ackr1-201ENSMUST00000038227 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 1700024P04Rik-201ENSMUST00000054425 481 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Zbtb26-202ENSMUST00000102789 2047 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Btbd16-204ENSMUST00000208593 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 A530040E14Rik-201ENSMUST00000093501 1515 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 9930024M15Rik-201ENSMUST00000214902 2584 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
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Rabgef1Q9JM13 Acly-207ENSMUST00000165111 4162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Igkv2-112-202ENSMUST00000103319 358 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
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Rabgef1Q9JM13 Tpi-rs8-201ENSMUST00000120382 708 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm6044-201ENSMUST00000121819 499 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm16008-201ENSMUST00000126009 810 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm15627-201ENSMUST00000140421 437 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
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Rabgef1Q9JM13 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
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Rabgef1Q9JM13 Ms4a3-202ENSMUST00000186023 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 2210420H20Rik-201ENSMUST00000188435 629 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm42654-201ENSMUST00000200789 494 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Olfr1396-203ENSMUST00000203007 981 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm44721-201ENSMUST00000206978 472 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Thy1-204ENSMUST00000214627 446 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm2915-201ENSMUST00000222565 787 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Fxyd2-201ENSMUST00000041005 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 5330417H12Rik-201ENSMUST00000060348 1191 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
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