Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm25767-201ENSMUST00000158572 124 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm23823-201ENSMUST00000158740 124 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm18779-201ENSMUST00000173444 577 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm27199-201ENSMUST00000185026 623 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm43218-201ENSMUST00000196275 344 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Rpl7a-ps7-201ENSMUST00000198361 776 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Kmt5a-212ENSMUST00000198451 1032 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm42529-201ENSMUST00000201843 741 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm45901-201ENSMUST00000203807 661 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm18988-201ENSMUST00000205601 746 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm38405-201ENSMUST00000207760 1140 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 2900045O20Rik-201ENSMUST00000218374 1292 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 AC153798.1-201ENSMUST00000219942 244 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm9305-201ENSMUST00000220962 599 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 AC192334.3-201ENSMUST00000221828 569 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm46342-201ENSMUST00000223411 602 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Pglyrp4-201ENSMUST00000047745 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Olfr46-201ENSMUST00000072655 957 ntAPPRIS P2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Olfr380-203ENSMUST00000127789 1536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Erp44-201ENSMUST00000030028 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm28791-201ENSMUST00000185888 1779 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Tpbpa-201ENSMUST00000021885 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Teddm1a-201ENSMUST00000050660 1317 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Olfr353-201ENSMUST00000100149 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Rhox1-201ENSMUST00000115210 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm15516-201ENSMUST00000117292 193 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm12455-201ENSMUST00000121242 416 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm6931-202ENSMUST00000183137 1009 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Olfr10-201ENSMUST00000187570 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Olfr1392-201ENSMUST00000189851 1018 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Skap2Q3UND0 Gpx4-ps2-202ENSMUST00000217344 782 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 282.5 ms