Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Olfr1214-202ENSMUST00000216026 2126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm43311-201ENSMUST00000200016 2377 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Olfr319-203ENSMUST00000215962 2500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gys2-201ENSMUST00000032371 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Cntn2-201ENSMUST00000086521 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm9866-206ENSMUST00000222838 1580 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Slc5a6-205ENSMUST00000202520 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm28370-201ENSMUST00000185303 3375 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Puf60Q3UEB3 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms