Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Ccndbp1Q3TVC7 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42977-201ENSMUST00000197497 144 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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Ccndbp1Q3TVC7 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Ccndbp1Q3TVC7 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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Ccndbp1Q3TVC7 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Tpd52l2-208ENSMUST00000149163 3603 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Ifrd1-204ENSMUST00000165027 1293 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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