Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Vmn2r40-201ENSMUST00000171942 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm15401-201ENSMUST00000081929 1107 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PrcdQ00LT2 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms