Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rps29P62274 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms