Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 4930417H01Rik-201ENSMUST00000123403 1233 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Olfr330-201ENSMUST00000134055 1134 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm14487-201ENSMUST00000145413 1259 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm22207-201ENSMUST00000158609 317 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm16334-201ENSMUST00000159488 694 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Phf11d-202ENSMUST00000160425 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm22461-201ENSMUST00000175272 70 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm21965-201ENSMUST00000177770 384 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Tcstv3-201ENSMUST00000178349 510 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm11109-201ENSMUST00000180289 384 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Mir124-2hg-205ENSMUST00000189467 173 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm42917-201ENSMUST00000200668 928 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 B230311B06Rik-202ENSMUST00000207610 687 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm45566-201ENSMUST00000209883 1168 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm7965-201ENSMUST00000211675 1105 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm45877-201ENSMUST00000212110 564 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm31698-201ENSMUST00000214227 430 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 AC025913.1-202ENSMUST00000220385 824 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GdnfP48540 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.6 ms