Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm22562-201ENSMUST00000157334 111 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RxraP28700 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm5920-201ENSMUST00000187390 853 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxraP28700 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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