Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm3269-201ENSMUST00000166025 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm7682-202ENSMUST00000202916 1582 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Abhd3-201ENSMUST00000002549 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm45088-201ENSMUST00000207066 1408 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Krt39-201ENSMUST00000076948 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Paip1-202ENSMUST00000109203 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm37886-201ENSMUST00000195349 1513 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm25594-201ENSMUST00000102274 82 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Ighv14-2-201ENSMUST00000103467 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Ighv1-67-201ENSMUST00000103538 294 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 n-R5s90-201ENSMUST00000103968 118 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm24335-201ENSMUST00000104211 132 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 0610037L13Rik-204ENSMUST00000106727 926 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm14336-201ENSMUST00000117491 475 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Pcna-ps1-201ENSMUST00000118453 738 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm15571-201ENSMUST00000119887 637 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Rps14-203ENSMUST00000122279 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm15627-201ENSMUST00000140421 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 1700056N10Rik-201ENSMUST00000141875 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm14061-201ENSMUST00000155923 1007 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm16596-201ENSMUST00000180576 604 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm26623-201ENSMUST00000180911 850 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm27043-201ENSMUST00000182807 958 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm29453-201ENSMUST00000186428 1279 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm36996-201ENSMUST00000194466 250 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm42997-201ENSMUST00000196074 918 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Mark4-ps-201ENSMUST00000196140 384 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm42952-203ENSMUST00000197784 798 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm42698-201ENSMUST00000197790 762 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm43607-201ENSMUST00000199524 336 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Iglc1-201ENSMUST00000200568 454 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm36849-201ENSMUST00000210345 680 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC122360.1-201ENSMUST00000217737 624 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC025913.1-202ENSMUST00000220385 824 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 AC167019.4-201ENSMUST00000226494 1070 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 CT025630.3-201ENSMUST00000228798 835 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Aamdc-201ENSMUST00000042627 627 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr543-201ENSMUST00000061482 1130 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 6330409D20Rik-201ENSMUST00000009695 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 1810053B23Rik-204ENSMUST00000185971 1309 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Platr22-201ENSMUST00000181274 1617 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm38251-201ENSMUST00000192968 2575 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Asic5-202ENSMUST00000107736 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm14762-202ENSMUST00000122953 1430 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Msr1-201ENSMUST00000026021 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Vpreb1P13372 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms