Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 2900026A02Rik-202ENSMUST00000211733 10238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Tshz2-201ENSMUST00000109157 5083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Scn2a-205ENSMUST00000200829 6348 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Wdr11-201ENSMUST00000084519 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Olfr1276-203ENSMUST00000218065 5052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 AC156025.3-201ENSMUST00000225919 3095 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ccdc180J3QNE4 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ccdc180J3QNE4 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ccdc180J3QNE4 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Ap3b2-201ENSMUST00000082090 3804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Rab7b-202ENSMUST00000064679 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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