Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Bgn-201ENSMUST00000033741 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Usp17lb-202ENSMUST00000106814 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 4933408N05Rik-201ENSMUST00000139864 1584 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Arl6-201ENSMUST00000023405 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm11232-201ENSMUST00000084489 1680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Stmn2-201ENSMUST00000029002 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Rnf185-202ENSMUST00000077078 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Zmym1-203ENSMUST00000106102 3852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 C1galt1c1-201ENSMUST00000058265 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Mcm6-203ENSMUST00000190495 4355 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Tead4-203ENSMUST00000130454 1718 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Camk2a-202ENSMUST00000039904 1734 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm12183-201ENSMUST00000120566 1848 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Scel-202ENSMUST00000227322 2443 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Fignl1-206ENSMUST00000171080 2844 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Pld1-203ENSMUST00000123539 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Adgrg1-201ENSMUST00000093271 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm40999-201ENSMUST00000222586 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Htr2b-201ENSMUST00000027431 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Zfp53-201ENSMUST00000076664 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Tnip3-208ENSMUST00000212402 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm9742-202ENSMUST00000222219 1396 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Serpina1b-201ENSMUST00000095450 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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Gm28038F7BCN9 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm12949-201ENSMUST00000143382 362 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm26483-201ENSMUST00000158016 104 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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Gm28038F7BCN9 Gm22014-201ENSMUST00000158785 290 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Olfr754-ps1-201ENSMUST00000173181 911 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm7611-201ENSMUST00000182329 1000 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm9568-201ENSMUST00000182514 1008 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm43572-201ENSMUST00000196494 519 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm43551-201ENSMUST00000197221 440 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm43246-201ENSMUST00000197597 564 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm18980-201ENSMUST00000199098 1079 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 1600020E01Rik-203ENSMUST00000204008 713 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm18840-201ENSMUST00000204553 506 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Ceacam10-203ENSMUST00000206847 662 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm45164-201ENSMUST00000207438 896 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm7397-201ENSMUST00000208298 361 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm46391-201ENSMUST00000220704 203 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 AC090654.1-201ENSMUST00000225584 1071 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Tmem202-201ENSMUST00000055345 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm28038F7BCN9 Slc51b-201ENSMUST00000065894 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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