Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm23946-201ENSMUST00000104423 197 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm8682-201ENSMUST00000121310 498 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Snhg12-203ENSMUST00000128131 614 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm14061-201ENSMUST00000155923 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Uchl1os-202ENSMUST00000177319 505 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Ms4a10-203ENSMUST00000191343 862 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm17978-201ENSMUST00000195986 769 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm42952-203ENSMUST00000197784 798 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Olfr326-ps1-201ENSMUST00000204790 392 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm8952-201ENSMUST00000206828 1102 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm45842-201ENSMUST00000211876 753 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AC153821.1-203ENSMUST00000218105 607 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 1700001C02Rik-201ENSMUST00000031078 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Ms4a10-201ENSMUST00000072748 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm4825-201ENSMUST00000079690 408 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AC122878.1-201ENSMUST00000227716 1460 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Rnf4Q9QZS2 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Rnf4Q9QZS2 n-R5s76-201ENSMUST00000122700 113 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Rnf4Q9QZS2 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Rnf4Q9QZS2 AF067061-202ENSMUST00000181748 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Rnf4Q9QZS2 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Dppa5b-201ENSMUST00000214261 348 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Dppa5c-201ENSMUST00000216268 348 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AC132384.1-201ENSMUST00000219908 1195 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AC163354.1-202ENSMUST00000221460 656 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AC154767.1-201ENSMUST00000224669 358 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AC100209.1-201ENSMUST00000225562 409 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AC124736.1-201ENSMUST00000226382 419 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 AC116596.2-201ENSMUST00000226642 526 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Pglyrp4-201ENSMUST00000047745 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Klk1b11-201ENSMUST00000007156 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 n-R5s28-201ENSMUST00000082814 119 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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