Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Teddm1a-201ENSMUST00000050660 1317 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm5442-201ENSMUST00000202121 2034 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Pkd2l2-201ENSMUST00000014647 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Paip1-202ENSMUST00000109203 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Abhd12b-206ENSMUST00000182927 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Tnip3-207ENSMUST00000212375 1543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Pcna-ps1-201ENSMUST00000118453 738 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm378-201ENSMUST00000120797 820 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Snhg12-203ENSMUST00000128131 614 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm14242-201ENSMUST00000145204 375 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 D630023F18Rik-202ENSMUST00000148020 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm17042-201ENSMUST00000167075 1216 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 H2-M10.4-202ENSMUST00000169950 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Pabpn1-208ENSMUST00000172557 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Ube2i-212ENSMUST00000174001 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm21943-201ENSMUST00000178181 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm9476-201ENSMUST00000179109 696 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Ly6a-202ENSMUST00000186526 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm29561-201ENSMUST00000187838 631 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm28723-201ENSMUST00000188640 1001 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Krtap14-202ENSMUST00000189774 856 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm6639-201ENSMUST00000196349 429 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm8143-201ENSMUST00000203654 1186 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 9530020I12Rik-202ENSMUST00000218368 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm5590-201ENSMUST00000059110 345 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Asb11-202ENSMUST00000036858 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Cldn12-203ENSMUST00000115446 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Cks1brt-202ENSMUST00000211617 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Nsun2-201ENSMUST00000022087 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Spx-204ENSMUST00000211094 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 1700027J07Rik-203ENSMUST00000217501 1884 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Obp2b-201ENSMUST00000114192 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm13198-201ENSMUST00000119322 826 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm5398-201ENSMUST00000121933 984 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm40614-201ENSMUST00000125161 1254 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm12320-201ENSMUST00000127333 1182 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm12223-201ENSMUST00000135468 528 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Rabgef1Q9JM13 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
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