Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Fkbp14-201ENSMUST00000046520 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Kif5a-202ENSMUST00000217895 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Cyld-201ENSMUST00000043526 8022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Myo6-203ENSMUST00000113266 7632 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Hip1-201ENSMUST00000060311 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm17034-201ENSMUST00000168990 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Kif26b-202ENSMUST00000161017 13749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Mical2-201ENSMUST00000037991 3352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms