Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

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Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Inpp5d-210ENSMUST00000169754 4937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Trpm1-218ENSMUST00000206277 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 AC160637.1-201ENSMUST00000214037 3887 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm43684-201ENSMUST00000199279 6573 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Mrpl19-201ENSMUST00000032124 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Xpo7-206ENSMUST00000228346 4491 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Trpv1-202ENSMUST00000102526 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc180J3QNE4 Entpd5-205ENSMUST00000120942 4881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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