Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 D330041H03Rik-203ENSMUST00000180579 605 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Aff4Q9ESC8 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms