Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm6150-201ENSMUST00000217775 577 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Arl15-202ENSMUST00000224068 1002 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC108416.3-201ENSMUST00000226148 557 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Snora57-201ENSMUST00000093658 148 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 CT025548.2-201ENSMUST00000226227 1329 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm32072-201ENSMUST00000200803 1434 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Vwa3b-206ENSMUST00000169057 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm22760-201ENSMUST00000102277 93 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Zscan30-201ENSMUST00000115829 484 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm11464-201ENSMUST00000146963 537 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm16541-201ENSMUST00000160992 614 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 S100a10-203ENSMUST00000170612 477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm8868-201ENSMUST00000173591 577 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 4833412C05Rik-202ENSMUST00000208257 850 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Olfr61-204ENSMUST00000211685 1212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC155644.1-201ENSMUST00000218527 890 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm11756-201ENSMUST00000107310 1312 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm13161-201ENSMUST00000120609 559 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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