Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm7979-201ENSMUST00000223009 1025 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 AC137117.2-201ENSMUST00000228560 282 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Olfr978-201ENSMUST00000057161 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Insl5-201ENSMUST00000084382 695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Cd36-201ENSMUST00000082367 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm20744-201ENSMUST00000208972 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Palmd-201ENSMUST00000040097 2433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Klhl15-209ENSMUST00000170594 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Cdh23-201ENSMUST00000073242 10688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Exosc10-201ENSMUST00000017408 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Polr3k-201ENSMUST00000039551 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Cabyr-202ENSMUST00000115857 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Vamp3-201ENSMUST00000030797 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gnl3l-202ENSMUST00000112691 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Chrna5-201ENSMUST00000093844 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Khdc1b-201ENSMUST00000147615 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm28382-201ENSMUST00000187902 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Rfx3-208ENSMUST00000174850 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Map4k4-209ENSMUST00000192509 3918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Crx-204ENSMUST00000174318 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Nutm2-201ENSMUST00000096633 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Zfp354b-203ENSMUST00000164280 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Pmm2-201ENSMUST00000023396 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Dnajc11-201ENSMUST00000062904 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Mup16-202ENSMUST00000107483 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Akr1c18-202ENSMUST00000110704 1103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm38390-201ENSMUST00000194859 1065 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm5857-201ENSMUST00000198953 493 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm23786-202ENSMUST00000200181 119 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm42789-201ENSMUST00000202276 567 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm26911-203ENSMUST00000204781 369 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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