Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Q3U6N9 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Arhgap12-212ENSMUST00000182559 4265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Slc17a6-201ENSMUST00000032710 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Kbtbd4-201ENSMUST00000090682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm17034-201ENSMUST00000168990 2229 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Prkd3-202ENSMUST00000118768 2847 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm15286-201ENSMUST00000150623 743 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Oasl2-201ENSMUST00000031542 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.5 ms