Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm44902-201ENSMUST00000206177 805 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 AC165260.6-205ENSMUST00000224190 9762 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Vmn1r52-203ENSMUST00000227100 2307 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Siah1bQ06985 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms