Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm29077-201ENSMUST00000185784 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm18970-201ENSMUST00000186040 938 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Cysrt1-203ENSMUST00000186719 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm28696-201ENSMUST00000189187 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm28206-201ENSMUST00000190437 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm37657-201ENSMUST00000195425 2169 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Mef2c-219ENSMUST00000198217 1257 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Mef2c-225ENSMUST00000199210 1185 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm36070-202ENSMUST00000200467 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm44233-201ENSMUST00000203616 226 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Ceacam10-203ENSMUST00000206847 662 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Atp6ap2-201ENSMUST00000033313 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Rad51ap1-201ENSMUST00000112220 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Ralgps2-201ENSMUST00000027886 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm21560-201ENSMUST00000168480 2066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 St3gal6-201ENSMUST00000114357 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Ifih1-202ENSMUST00000112459 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Zfp949-204ENSMUST00000162827 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Fer-201ENSMUST00000000129 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Eny2-201ENSMUST00000060652 3000 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Atxn3-201ENSMUST00000021606 5363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Fut10-203ENSMUST00000161502 3527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Dusp27-201ENSMUST00000085992 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm19589-201ENSMUST00000189394 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Thsd1-201ENSMUST00000069828 4422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Enox2-203ENSMUST00000114912 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Rtel1-204ENSMUST00000108814 4322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Adcy4-202ENSMUST00000170223 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LtbrP50284 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 CT025642.3-201ENSMUST00000225503 4086 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Ehmt1-204ENSMUST00000114418 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Snhg7os-202ENSMUST00000131841 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Vnn1-201ENSMUST00000041416 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm8138-201ENSMUST00000169473 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm8165-201ENSMUST00000095981 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm12838-201ENSMUST00000116278 325 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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LtbrP50284 Gm12970-201ENSMUST00000134911 581 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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LtbrP50284 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm5256-201ENSMUST00000191412 877 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Klk1b14-ps-201ENSMUST00000206059 777 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm45213-201ENSMUST00000206065 304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm45346-201ENSMUST00000209925 1273 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 AC134607.2-201ENSMUST00000213983 231 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 AC192333.4-201ENSMUST00000224269 981 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 AC122251.1-201ENSMUST00000227717 639 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Slc15a5-206ENSMUST00000171804 2461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LtbrP50284 AC122402.1-201ENSMUST00000225199 2303 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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