Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm42977-201ENSMUST00000197497 144 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm1947-201ENSMUST00000122451 910 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms