Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Gm11259-201ENSMUST00000120554 715 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
P20040 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Gm4451-201ENSMUST00000186000 1891 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Fxyd5-207ENSMUST00000161684 1172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
P20040 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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