Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm43161-201ENSMUST00000197020 1688 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ap5s1-202ENSMUST00000110206 703 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm13573-201ENSMUST00000116410 631 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm6275-201ENSMUST00000118971 1122 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm5761-201ENSMUST00000119238 834 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Chn1os1-201ENSMUST00000123613 636 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm18779-201ENSMUST00000173444 577 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Sfta2-202ENSMUST00000174521 649 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 2610020F03Rik-201ENSMUST00000180401 588 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Lyzl1-201ENSMUST00000025076 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Cytl1-201ENSMUST00000073554 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Fcgr4-201ENSMUST00000078825 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm21129-201ENSMUST00000185932 2560 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm29258-201ENSMUST00000186842 2564 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gc-201ENSMUST00000049209 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Serpina1a-202ENSMUST00000085056 1360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Adam5-202ENSMUST00000118419 2791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Fbxo3-203ENSMUST00000111135 3740 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm36251-201ENSMUST00000213712 1914 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm7682-202ENSMUST00000202916 1582 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Fgg-201ENSMUST00000048486 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm9903-201ENSMUST00000181102 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm37159-201ENSMUST00000192720 3605 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Pilrb2-201ENSMUST00000164886 1807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm35147-201ENSMUST00000208383 1820 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 4933402N03Rik-201ENSMUST00000070980 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Hmgn2-202ENSMUST00000102552 676 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Igkv6-25-201ENSMUST00000103383 380 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Trav12-1-201ENSMUST00000103650 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm9392-201ENSMUST00000119337 554 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm14186-201ENSMUST00000120804 137 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms