Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm46995-201ENSMUST00000223445 1378 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Cxcl5-201ENSMUST00000031318 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Rps6-ps4-201ENSMUST00000118499 750 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm8172-201ENSMUST00000120762 750 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 4930455G09Rik-201ENSMUST00000126231 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Banf2os-202ENSMUST00000145504 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm6871-204ENSMUST00000171059 462 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r-ps52-201ENSMUST00000176211 612 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm27043-201ENSMUST00000182807 958 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm28677-202ENSMUST00000186904 615 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm42525-201ENSMUST00000196257 527 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm7442-201ENSMUST00000197778 383 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm6150-201ENSMUST00000217775 577 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Snora65-201ENSMUST00000083190 130 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Rnf4Q9QZS2 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 4921515L22Rik-201ENSMUST00000218993 1537 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Rnf4Q9QZS2 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Trav12-1-201ENSMUST00000103650 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Rnf4Q9QZS2 Rpsa-ps3-201ENSMUST00000117789 876 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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Rnf4Q9QZS2 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 4930519F09Rik-202ENSMUST00000163084 1111 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm28864-201ENSMUST00000189251 644 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 1600020E01Rik-203ENSMUST00000204008 713 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 AC154028.1-201ENSMUST00000217071 379 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 AC165157.2-201ENSMUST00000222265 367 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 AC134577.2-201ENSMUST00000228541 715 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 n-R5s74-201ENSMUST00000082654 116 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Defa28-201ENSMUST00000098887 400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 2310069B03Rik-202ENSMUST00000186147 1833 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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