Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lrrc9Q8CDN9 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 AC113031.6-202ENSMUST00000228468 1145 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lrrc9Q8CDN9 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Palb2-202ENSMUST00000098068 3750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Btn2a2-203ENSMUST00000110433 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Mcf2l-208ENSMUST00000110879 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lrrc9Q8CDN9 Trim2-201ENSMUST00000054990 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Cd300lb-203ENSMUST00000149663 2641 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Sgsh-201ENSMUST00000005173 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lrrc9Q8CDN9 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Olfr319-203ENSMUST00000215962 2500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lrrc9Q8CDN9 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lrrc9Q8CDN9 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lrrc9Q8CDN9 6820431F20Rik-202ENSMUST00000153748 4659 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lrrc9Q8CDN9 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Luc7l-202ENSMUST00000114976 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Lrrc9Q8CDN9 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Lrrc9Q8CDN9 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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