Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm12170-201ENSMUST00000119281 300 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm12192-201ENSMUST00000120146 487 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm14528-201ENSMUST00000120615 231 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm12780-201ENSMUST00000122458 645 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm15873-201ENSMUST00000123390 761 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 A930019D19Rik-201ENSMUST00000135360 958 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm16585-201ENSMUST00000161442 610 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm17053-201ENSMUST00000163501 495 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Btnl5-ps-202ENSMUST00000173333 461 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 1110059E24Rik-202ENSMUST00000177577 599 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm7577-201ENSMUST00000182543 982 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Mef2c-219ENSMUST00000198217 1257 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Mef2c-225ENSMUST00000199210 1185 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm7879-202ENSMUST00000200338 635 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm7384-201ENSMUST00000203682 530 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm44033-201ENSMUST00000203699 695 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Olfr46-202ENSMUST00000211771 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC159899.1-201ENSMUST00000214024 733 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm2649-201ENSMUST00000218825 610 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm18114-201ENSMUST00000221780 523 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC211878.7-201ENSMUST00000222851 661 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC139130.1-201ENSMUST00000228281 620 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Olfr46-201ENSMUST00000072655 957 ntAPPRIS P2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1418-201ENSMUST00000079875 1072 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm12378-201ENSMUST00000116171 1461 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 1110019D14Rik-202ENSMUST00000181225 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC132467.1-201ENSMUST00000226498 1845 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Dcdc5-203ENSMUST00000126340 396 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm11399-201ENSMUST00000131021 324 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm12930-201ENSMUST00000146679 676 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 4930519F09Rik-202ENSMUST00000163084 1111 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm3002-202ENSMUST00000178256 444 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm2974-202ENSMUST00000180184 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm19402-201ENSMUST00000180297 801 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm29436-202ENSMUST00000189054 1172 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm43837-201ENSMUST00000200306 668 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm18485-201ENSMUST00000203788 1114 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms