Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Fmn1-203ENSMUST00000102547 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Zmym1-201ENSMUST00000055013 3001 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Add2-209ENSMUST00000204059 8182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Chek2-201ENSMUST00000066160 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm43621-201ENSMUST00000202733 2022 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Cers4-201ENSMUST00000008350 9475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Zfp445-206ENSMUST00000216063 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Klhl32-203ENSMUST00000108214 5970 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms