Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Aldh18a1-207ENSMUST00000176939 3427 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm12838-201ENSMUST00000116278 325 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 1700024P04Rik-201ENSMUST00000054425 481 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
RxraP28700 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Anp32b-ps1-201ENSMUST00000122215 758 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 A530083I20Rik-202ENSMUST00000180877 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm37506-201ENSMUST00000192008 143 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
RxraP28700 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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