Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Mup-ps24-201ENSMUST00000119939 286 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Lyzl1-202ENSMUST00000120837 652 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm3571-201ENSMUST00000170703 1060 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Vmn2r-ps52-201ENSMUST00000176211 612 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm28193-201ENSMUST00000189863 615 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 AC154028.1-201ENSMUST00000217071 379 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 AC134577.2-201ENSMUST00000228541 715 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
VimP20152 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
VimP20152 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm13576-201ENSMUST00000120851 778 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Fhad1os1-201ENSMUST00000146094 997 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm17157-201ENSMUST00000172397 348 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm27043-201ENSMUST00000182807 958 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm44649-202ENSMUST00000206896 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 AC162893.1-201ENSMUST00000207732 1085 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Chmp2a-204ENSMUST00000211344 606 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Chmp2a-206ENSMUST00000211626 726 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm32834-202ENSMUST00000222417 655 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Hist1h1t-201ENSMUST00000041052 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Lgals9-201ENSMUST00000073001 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm6819-201ENSMUST00000185325 1891 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 D130007C19Rik-201ENSMUST00000067277 1505 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
VimP20152 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Trav12-1-201ENSMUST00000103650 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Rpsa-ps3-201ENSMUST00000117789 876 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm15369-201ENSMUST00000119681 394 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Mir5623-201ENSMUST00000176631 70 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VimP20152 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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