Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Glcci1-202ENSMUST00000161217 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm12464-201ENSMUST00000121385 1016 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm44451-201ENSMUST00000203767 483 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Ube2e2-201ENSMUST00000076133 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Myo1h-201ENSMUST00000124316 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Igkv12-41-201ENSMUST00000103369 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm26469-201ENSMUST00000116765 121 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm8084-201ENSMUST00000120807 752 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 1700015G11Rik-201ENSMUST00000180038 397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm38306-201ENSMUST00000193954 237 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Pisrt1-201ENSMUST00000195532 515 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms