Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Gm38242-201ENSMUST00000192354 430 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm18973-201ENSMUST00000205814 511 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm8512-201ENSMUST00000215367 471 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Mrgprb4-201ENSMUST00000094388 1219 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Magea2-201ENSMUST00000069477 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Fam90a1a-201ENSMUST00000110741 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Zfp866-201ENSMUST00000131784 2680 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Tmem177-201ENSMUST00000037906 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Mgam2-ps-203ENSMUST00000216691 1709 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm15999-201ENSMUST00000127317 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Ccdc141-207ENSMUST00000164114 6222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Parp9-201ENSMUST00000023622 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Grhl3-201ENSMUST00000105855 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 CT009536.1-201ENSMUST00000223774 2151 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Cd101-202ENSMUST00000167086 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Mro-201ENSMUST00000119239 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Baz2a-202ENSMUST00000170054 8372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Baz2a-201ENSMUST00000045621 8369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Dlk1-208ENSMUST00000173539 3914 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TsksO54887 Ctnna2-201ENSMUST00000075340 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm17359-203ENSMUST00000199658 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Kcnip4-204ENSMUST00000166924 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Ptbp3-210ENSMUST00000173699 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Heatr9-201ENSMUST00000019069 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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TsksO54887 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Pla2g6-210ENSMUST00000174021 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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TsksO54887 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
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TsksO54887 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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TsksO54887 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm15433-201ENSMUST00000097671 891 ntBASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Zfp961-201ENSMUST00000109997 2713 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Oprl1-201ENSMUST00000071585 2999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Il1rap-203ENSMUST00000166294 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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TsksO54887 Glrx-204ENSMUST00000223120 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Nos1-207ENSMUST00000171055 4388 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 B230364G03Rik-201ENSMUST00000181479 1374 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Gm19589-201ENSMUST00000189394 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Frk-202ENSMUST00000170771 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Mlip-210ENSMUST00000184322 2668 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
TsksO54887 Olfr1497-202ENSMUST00000217384 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TsksO54887 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms