Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Tmem69-202ENSMUST00000106478 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm11730-202ENSMUST00000147186 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Dcpp2-202ENSMUST00000168272 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Mir5623-201ENSMUST00000176631 70 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Mir7060-201ENSMUST00000183486 137 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm20257-201ENSMUST00000185352 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm42698-201ENSMUST00000197790 762 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Mef2c-219ENSMUST00000198217 1257 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Mef2c-225ENSMUST00000199210 1185 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm6308-201ENSMUST00000203226 313 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm5609-201ENSMUST00000210008 1267 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm34278-201ENSMUST00000220534 622 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 AC129975.2-201ENSMUST00000223705 775 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 AC110236.1-201ENSMUST00000227807 527 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 AC107711.5-201ENSMUST00000228149 594 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Olfr419-201ENSMUST00000061990 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Klk1b11-201ENSMUST00000007156 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm5721-201ENSMUST00000119845 1696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Cpa5-203ENSMUST00000115139 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Acvr1-204ENSMUST00000112601 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Zscan21-205ENSMUST00000110961 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Rpap2-203ENSMUST00000112651 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 4930503E24Rik-201ENSMUST00000219167 1333 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Fbxo16-203ENSMUST00000224629 3781 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm1988-201ENSMUST00000188190 2565 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Serpina1a-201ENSMUST00000072876 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 4930578I07Rik-201ENSMUST00000193416 1372 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm37673-201ENSMUST00000194880 2451 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Ripor2-203ENSMUST00000091694 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 AC122346.2-201ENSMUST00000224326 2931 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm1982-201ENSMUST00000188615 1887 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm44802-201ENSMUST00000208026 1916 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm28852-201ENSMUST00000186666 2160 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm28880-201ENSMUST00000190161 2160 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm12089-201ENSMUST00000138402 428 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm20765-201ENSMUST00000177792 795 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gm2035J3QP87 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms