Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vstm4T1NXB5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms