Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsc22d3Q9Z2S7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms