Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms