Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Robo3Q9Z2I4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Robo3Q9Z2I4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms