Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stk39Q9Z1W9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms