Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek4Q9Z1J2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms