Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hmg20bQ9Z104 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hmg20bQ9Z104 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms