Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup160Q9Z0W3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 341.7 ms