Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn13Q9Z0S4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn13Q9Z0S4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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