Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnip1Q9WUU8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms