Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUT7

Ccr9, C-C chemokine receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr9Q9WUT7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccr9Q9WUT7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccr9Q9WUT7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccr9Q9WUT7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccr9Q9WUT7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccr9Q9WUT7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms