Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scnn1bQ9WU38 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms